Ao contrário das previsões, Sábado estava seco em Sepang e os pilotos das Moto3 foram para a pista dedicados a completar a pré-qualificação que veria os primeiros 14 passar diretamente à Q2. Nos tempos combinados, os líderes eram Toba, Rodrigo, Suzuki e McPhee mas a FP3 seca iria mudar tudo isso.
Logo no começo, Fenati chocou com Salac ao tentar passa-lo por fora na Curva 3 e ambos caíram.
Depois, com o evoluir da sessão, foi Suzuki mais uma vez a liderar, seguido de Vietti, Rodrigo, Dalla Porta, Ramirez, Sasaki, Ogura, Canet, Toba, McPhee e Binder já fora do Top 10. Ainda qualificados estavam Migno, Lopes e o próprio Fenati.
Até 3 minutos do final, Suzuki permanecia no topo com o seu tempo de 2:11.673, e os últimos segundos mais pareceram uma corrida, com os pilotos a andarem em grupos onde se ultrapassavam mutuamente e inúmeros intermédios de volta rápida a acender na tabela… porém Suzuki acabou mesmo no comando.
Moto3, Malásia, FP3 Top 10
| 1 | 24 | T. SUZUKI | 2:11.673 |
| 2 | 13 | C. VIETTI | +0.420 |
| 3 | 19 | G. RODRIGO | +0.462 |
| 4 | 48 | L. DALLA PORTA | +0.516 |
| 5 | 42 | M. RAMIREZ | +0.682 |
| 6 | 71 | A. SASAKI | +0.686 |
| 7 | 79 | A. OGURA | +0.713 |
| 8 | 44 | A. CANET | +0.793 |
| 9 | 27 | K. TOBA | +0.793 |
| 10 | 17 | J. MCPHEE | +0.961 |
