Piloto mais rápido nos treinos livres, Marc Márquez, não conseguiu aplicar a mesma receita na qualificação do GP do Japão, em Motegi. O piloto da Honda liderou grande parte da sessão no entanto nos últimos minutos cometeu dois erros, nas Curvas 3 e 11, e foi superado por Valentino Rossi.
Apesar desta situação no final o líder do Mundial confessou estar “contente apesar de que podia ter feito mais. Senti-me muito melhor do que estava à espera na segunda saída para a pista. Consegui ser rápido. No entanto na última tentativa não puxei ao máximo devido às bandeiras amarelas por causa da queda do Cal Crutchlow. Também devido às quedas do Dani Pedrosa e de Jorge Lorenzo não quis arriscar”.
